In Fertő-Hanság Nationaal Park ligt het grootste meer van Centraal Europa, namelijk het meer Fertő. Dit meer is tevens het meest westelijk gelegen zoutmeer van Eurazië. Door het ondiepe waterlevel van het meer en de heersende wind is het meer voortdurend aan verandering onderhevig. Het gebied rondom het meer is zeer rijk aan vogels, zoals onder andere de grote zilverreiger, de purperreiger, de lepelaar en de grauwe gans. Tijdens het migratie seizoen strijken hier vele andere trekvogels neer.

 

 

Zeldzame vogels die men hier kan vinden zijn onder andere de roodhalsgans, de zeearend en de blauwe kiekendief. Op de weilanden ten westen van het meer kan men ook een bijzondere vegetatie vinden met zeldzame plantensoorten. Zo zijn hier onder andere de volgende soorten te vinden: de Cypripedioideae (een plant uit de familie van de orchideeën), de vliegenorchis, de baardiris en de zwaardlelie. Het gebied kent ook verscheidene vlindersoorten. In het oostelijke gedeelte van het gebied kan men andere flora soorten tegenkomen, zoals onder andere kweldergras, de zeeaster en klein schorrenkruid. 

 

 

In de bossen rondom het meer Fertő zijn ook vele moerasgebieden te vinden. Een belangrijk gebied is het Szárhalmi Woud. De flora en fauna die hier te vinden zijn, zijn zeer vergelijkbaar met die van de bergen vanwege de klimatologische effecten in het gebied. De dominante bomensoorten in dit gebied zijn de wintereik en de haagbeuk. Daarnaast kan men hier ook de zomereik en de moseik vinden, en sporadisch een lijsterbes of een wilde kers. In het bos leven ook vele vogels, zo kan men het gezang van de nachtegaal, de geelgors en andere zangvogels in het bos horen.